Le but principal de ce stage de 24 semaines a été l'étude de la cinétique d'apparition/disparition des métabolites de dégradation bactérienne du phénanthrène dans le cadre du projet HARPO visant à étudier le devenir des Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques (HAP) dans les sols.
Les expériences menées dans cet objectif sont la maturation durant deux mois de deux types de solide en présence de phénanthrène, puis l'ajout de deux cultures bactériennes cultivées sur phénanthrène. Afin d'étudier la cinétique de minéralisation, l'activité du surnageant et la quantité de CO2 produite étaient mesurées par scintillation grâce au phénanthrène marqué au carbone 14, tandis que la cinétique d'apparition/disparition des métabolites était suivie par HPLC/UV.
La première partie de mon stage a permis la réalisation d'un rapport bibliographique sur les métabolites des HAP produits par différents microorganismes tels les bactéries, les algues ou les champignons, leurs voies de dégradation, ainsi que les protocoles d'extraction et d'analyse employés.
La seconde partie de mon stage aura été consacré aux manipulations, à la collecte et au traitement de mes propres résultats et des résultats du stagiaire qui m'a précédé et qui avait réalisé les mêmes expériences sans solide ou avec solide et, dans ce cas, avec différents temps de maturation (sans maturation et 48 heures de maturation). Anne Moussay et moi-même avons également accordé notre temps à la recherche d'un standard interne permettant de déterminer précisément le rendement de chaque extraction liquide/liquide des surnageants des milieux de culture, ainsi qu'à la réalisation et à l'optimisation d'un protocole d'extraction sur cartouche.
La suite de l'étude consistera en la mise en culture des deux types de bactéries avec les deux sols et un temps de maturation d'un an. L'autre étape indispensable sera la poursuite de l'identification des différents métabolites produits par HPLC/MS et la détermination des voies de dégradation du phénanthrène par les deux cultures bactériennes.
[...] De 1965 à 1975, le B.R.G.M. est transféré de Paris à Orléans. Se développent alors, en parallèle des marchés commerciaux dans le domaine de l'eau, la vente de services géologiques (au niveau national et international) et des capacités dans le domaine de la mécanique des roches et des sols. C'est donc l'activité bureau d'étude qui prend une part de plus en plus importante (les ressources provenant de cette activité iront jusqu'à représenter plus de la moitié du budget en 1990). [...]
[...] On définit alors le coefficient normalisé de partage Koc : Koc = Kd / foc Des expériences réalisées au B.R.G.M. (Saada et al., 2000) ont permis de corréler l'adsorption du phénanthrène à la présence de matière organique. La mise en contact de solutions de phénanthrène à plusieurs concentrations sur de la kaolinite (foc = 0,006 et de la kaolinite recouverte de deux types de goudrons (foc = et foc = 0,64 a mis en évidence l'influence de la présence de carbone organique. [...]
[...] Les manipulations ont été réalisées dans les laboratoires du service Analyse et Caractérisation Minérale/Mesures in Situ et Expérimentations sous la responsabilité de Catherine Crouzet. Les principales activités du service ANA sont présentées ci-dessous : analyses physico-chimiques et isotopiques ; caractérisations minérales ; diagnostic et analyse de l'empoussièrement (amiante, silice) ; ingénierie de laboratoires ; mesure et prélèvement in situ et laboratoire de géochimie expérimentale. Le B.R.G.M., dont le centre scientifique et technique est basé à Orléans-La Source, emploie 860 personnes dont plus de 600 chercheurs, ingénieurs et techniciens dans toutes les disciplines des sciences de la Terre. [...]
[...] est composé de sept principaux services opérationnels (Connaissance et diffusion de l'information géologique, Ressources minérales, Aménagement et risques naturels, Eau, Environnement industriel et procédés, Analyse et caractérisation minérale, Service des actions régionales) comprenant eux-mêmes différentes unités organisées en groupes de travail Historique En 1941, Edmond Friedel et Pierre Pruvost sont à l'origine de la fondation du Bureau de Recherches Géologiques et Géophysiques (B.R.G.G.), créé afin d'établir des archives du sous-sol français. En 1944, le B.R.G.G. est chargé de l'instruction des dossiers de déclaration aux services des mines des ouvrages souterrains de plus de dix mètres de profondeur. [...]
[...] Ce sont des composés neutres apolaires formés de noyaux benzéniques (au minimum deux) fusionnés par des arrangements linéaires, angulaires ou en coin. Ils diffèrent par leurs propriétés physico-chimiques : les HAP de faible poids moléculaire sont plus volatils, plus solubles dans l'eau, donc moins lipophiles et plus biodégradables que les HAP de fort poids moléculaire. La persistance environnementale et la génotoxicité augmentent avec la taille des HAP (ANNEXE 1 et ANNEXE 2). Ces caractéristiques et leur présence dans toutes les régions industrialisées ont motivé l'administration américaine à le classer comme un des polluants prioritaires sur la liste des composés dont la concentration doit diminuer dans les années à venir. [...]
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